Konsep untuk memajukan ilmu Etnobiologi di Indonesia dijabarkan dalam Program Kerja Perhimpunan Masyarakat Etnobiologi Indonesia sebagai berikut:
Menerbitkan majalah ilmiah setiap enam bulan dan edisi khusus untuk kepentingan tukar menukar informasi diantara para anggota, yang memuat tulisan ilmiah Etnobiologi di Indonesia.
Kerja sama penelitian Etnobiologi dengan berbagai pihak, baik dari dalam negeri maupun luar negeri sehingga menghasilkan karya ilmiah yang dapat dimuat dalam Journal of Tropical Ethnobiology (peer-reviewed).
Mengadakan kerjasama mengumpulkan artefak Etnobiologi untuk kepentingan Museum Nasional Sejarah Alam Indonesia, yang dulunya bernama Museum Etnobotani Indonesia.
Menyelenggarakan pertemuan ilmiah Etnobiologi (lingkup Nasional dan Internasional) yang pelaksanaannya bekerjasama dengan organisasi profesi ilmiah lain.